Попробовать прописать в конфиге check_tables=yes
А вообще нужно обеспечить сервер бесперебойным питанием, так как сервер не должен перегружаться по питанию.
незнаю незнаю check_tables="yes" у меня уже давненько стоит, тока нихрена не помогает, и приходется маиться дурью и заменять файлы в базе подобными (да да и поро этим занимаюсь по причине того что я знаю sql ооочень поверхностно).Просто незабывай сделать backup да и всё тут.